本來代善已經準備支持豪格了，代善的兩個旗加上豪格的三個旗，豪格完全有能力稱帝，但是豪格在這時候謙讓了一下，這個機會立馬就讓多爾袞抓住了。由于雙方的態度都非常堅定，誰也無法說服誰，最后大家只好各退一步，接受了濟爾哈朗的建議，立皇太極的幼子福臨為帝，福臨就是后面的順治帝。
多爾袞因為自己沒當成皇帝，于是在順治在位的時候，多次打擊鰲拜，有時候只是因為一些小事就把鰲拜貶為庶人，不過也一直沒置鰲拜于死地，俗話說，“只要不死，終會出頭”
順治七年，多爾袞病逝，當時鰲拜已經被多爾袞攆回家了，順治親政之后清除了多爾袞的余黨之后，又想起了鰲拜，回想起鰲拜這么多年來的功績，尤其他對皇帝一直是忠心耿耿。于是鰲拜被順治調回來重新掌權。
可以說，順治朝的時候，鰲拜和順治帝以及孝莊皇太后的關系是十分融洽的，不過好景不長，順治在18年的時候病逝。他臨死前特命內大臣索尼、蘇克薩哈、遏必隆、鰲拜四大臣輔政，輔佐年僅八歲的幼帝康熙即位。
由于索尼年紀已經很大了，蘇克薩哈原是多爾袞的人，所以被索尼和其他人所看不起，而遏必隆沒有主見，經常依附于鰲拜，所以鰲拜理所當然的就成了真正意義上的一把手了。
鰲拜主政之初還是做了不少實事的，例如整頓吏治，實施“湖廣填四川”，實行更名田，減少了很多不必要的軍事活動，但為了打擊中原文人，鰲拜也制造了不少文字獄，打擊了很多文人。
同時為了鞏固自己在朝中的地位，鰲拜多次找人彈劾當時朝中的外國傳教士湯若望，甚至差點處死湯，最后湯在孝莊太后的保護下雖然沒被處死，但也郁郁而終了。
