減少賠款
傳說談判中日本要求中國賠償三萬萬兩白銀，但李鴻章挨了一顆子彈以后，日本當即減少一萬萬兩賠款，此說并不屬實。歷史上李鴻章是在第三輪談判后遇刺的，當時日方根本沒有要求清朝賠款三萬萬兩。1895年4月1日第四輪談判時，日本才亮出了三萬萬兩白銀的賠款。4月3日，陸奧宗光在致日本駐各國使節的電報中明確說：“作為獲得偉大勝利之結果，我方要求之條件決非過高，而提出較次更少之要求，日本國民終究不能滿意”，要求他們對列強“相機為我方要求條件進行辯護”。 由此可見，日本起初是咬定三萬萬兩的賠款條件的。到了4月9日，中方向日方提交了賠款改為一萬萬兩的修正案，與此同時日本人在破譯李鴻章電報時看到“倘彼猶不足意，始終堅執……只有罷議而歸”一句時感到恐慌，因為日本最害怕的狀況就是李鴻章停止談判歸國，引發列強干涉，于是伊藤博文等決定作出讓步，明治天皇也說，萬一談判破裂，即便日軍打到北京，也“難免要受外國的干涉，最后割據的領土也將成為泡影”，遂同意讓步方案。4月10日第五輪談判，日本出示的最終修正案中將賠款折中為二萬萬兩白銀，此后不再更改。從日本減少賠款的過程可以看出，其關鍵因素是對歐美列強的忌憚，而并非小山豐太郎行刺后為撫慰李鴻章所致的。小山豐太郎行刺所導致的直接后果就是日本同意無條件停戰，最多只能看作是減少賠款的間接因素。李鴻章在奏折中則將日本讓步歸結為自己“力與堅持，多方開導”的結果，雖不無自夸之嫌，但也沒提及他是被日本人槍擊后才減少了一萬萬兩賠款的。
不履日地
李鴻章在《馬關條約》談判時費盡心力，伊藤博文則態度強硬，極盡羞辱之能事。在條約締結前最后一次談判時，李鴻章對伊藤博文說：“沒有想到閣下是如此嚴酷執拗之人！” 隨后憤然離去。李鴻章登船回國，發誓終生不再踏上日本土地。一年后李鴻章訪問美國時途經日本，果然因“銜馬關議約之恨，誓終身不復履日地，從人敦勸萬端，終不許”，終于沒在日本上岸。
棄臺傳聞
傳說李鴻章曾向慈禧太后或光緒皇帝進言“臺灣鳥不語，花不香，男無情，女無義，割讓出去并不可惜”，這句話被廣為引用。然而也有相關研究及評論者指出，根據所有可見史料檔案，未能發現李鴻章發表這段評語的記錄。相反，李鴻章在與當時日本首相伊藤博文進行《馬關條約》的談判時曾聲明“臺灣土地肥沃、物產饒多，民亦服王化，設官署，置吏員，純然如本土” 、“擬請所讓之地，如果勒令中國照辦，兩國子子孫孫永成仇敵，傳至無窮矣” 、“臺灣已立一行省，不能送給他國” ，等等。
