天命十一年（1626）七月二十三日，努爾哈赤染病，到清河溫泉療養。八月初七日，因病勢沉重，決定返回沈陽，乘船順太子河而下，同時派人召大福晉阿巴亥來見。阿巴亥所乘的船，在渾河上的叆雞堡河段與努爾哈赤所乘的船相遇，準備隨后一起趕往沈陽。然而，努爾哈赤再也沒有回到沈陽，再也沒有見到他的兒子和部屬們。八月十一日未時（下午13-15時），六十七歲的努爾哈赤死在了渾河的船上，地址正在叆雞堡，距離沈陽四十里。阿巴亥只能陪著丈夫的尸體返回皇宮。阿巴亥成了陪伴努爾哈赤最后一刻的唯一一人。
努爾哈赤至死都沒有確立繼承人，后金王位的歸屬，成了一個極大的問題。按照努爾哈赤生前曾經制定的“大汗共推”之說，皇太極被推舉為新汗。然而，這位新汗此時所擔憂的是阿巴亥作為努爾哈赤臨終前唯一的陪伴者——假如這位大福晉對皇太極繼位不滿，說出什么不利于新汗的“遺言”、或者以她的正妻的名份再加上三個兒子手里的軍隊來圖謀汗位呢？于是，一個陰謀出臺了。
八月十二日寅（凌晨3-5時）時，代善宣布了皇太極繼位的消息。剛死了丈夫的阿巴亥并沒對這個消息做出任何反映，因為這畢竟是諸皇族共推之舉。但是卯時（清晨5-7時）又一個消息被宣布：先帝早有遺命交代諸王——大福晉殉葬。
除了努爾哈赤療養的短短十幾天之外，阿巴亥一直跟隨的丈夫身邊，丈夫臨終時也只有自己陪伴，他不可能、也沒有時間見過這些王公，留下這樣一條遺囑。然而阿巴亥的哭叫和辯解沒有任何作用，所有的成年王爺和大臣都趕到了她所住的宮室，各種各樣的眼睛都緊緊地盯著她，惡狠狠的話也從這些道貌岸然的男人嘴里吐出來：“先帝有命，雖欲不從，不可得也。”
皇太極為什么不殺多爾袞 是不是阿巴亥的關系
當明白自己不可能逃脫死亡之后，阿巴亥恢復了神智，這時候她唯一的愿望，就是能夠以自己的死確保三個兒子的平安。于是她更換了大福晉的禮服，佩戴上了自己所有的珠寶首飾，哭著向諸王請求：“吾自十二歲事先帝，豐衣美食，已二十六年。吾不忍離，故相從于地下。吾二幼子多爾袞多鐸，當恩養之。”諸王這時也流下了鱷魚的眼淚，當眾一齊盟誓：“二幼弟，吾等若不恩養，是忘父也，豈有不恩養之理！”于是，36歲的阿巴亥自縊殉葬（也有說法是被弓弦勒死），她死的時間是當天早晨的辰時（上午7-9時），距努爾哈赤去世不到二十個小時、距返回沈陽剛一個晚上，距殉葬令公布還不到一個時辰。她死后與努爾哈赤同棺斂葬。巳時（上午9-11時），棺木便迅速成殮。（從逼她殉葬到把尸體裝進棺材不過三四個小時）同殉者還有兩位庶妃，其中包括那位德因澤。這也許是皇太極卸磨殺驢，又或者叫殺人滅口。
