就這樣，汪直以西廠為據點，勾結一些朝官結黨，排除異己，陷害忠良，權傾天下，弄得朝野上下人心惶惶，反對之聲不絕于耳。此時，以大學士商輅為首的輔政大臣挺身而出，集體上書，向憲宗痛陳西廠之危害，并將汪直肆意二位的不法之事一一舉報。憲宗收到奏章后大為震驚，于是撤銷了西廠，遣散了西廠的工作人員。此時距西廠成立僅僅只有五個月時間，但沒有西廠的日子總讓憲宗覺得沒有安全感。寵臣戴縉得知他的這種心思后，便主動上書，大肆吹捧汪直。憲宗看了大喜，立刻恢復西廠，并給戴縉升了職。西廠，這個憲宗精心布局的特務機構，撤銷與恢復之間，僅僅相隔一個月。西廠恢復了，汪直再次成為西廠的領導，更加肆無忌憚地嚴酷辦案，在此后的五年里，汪直領導西廠又辦下了無數的大案、要案，并將反對自己的朝臣如商輅、項忠等一一剪除，他的權勢也達到了極點。但俗話說：“物極必反”，汪直極度膨脹的權力不能不引起憲宗的警覺，在其后的權力角逐中，汪直敗北，被調出京城，西廠也隨之解散。幾年以后，汪直在失意中落寞地死去。
到了明憲宗的孫子明武宗繼位后，大太監劉瑾擅權專政，太監勢力再度興起，西廠復開，由太監谷大用領導。但令劉瑾始料不及的是，西廠與東廠雖然都受他一個人的指揮，但兩者之間不是互相合作，而是爭權奪利，互相拆臺。為了改變這種情況，劉瑾又自建了一個內行廠，由他自己直接領導，其職能與東西兩廠一樣，但偵緝諜報的范圍更大，甚至包括錦衣衛和東西兩廠。一時間，錦衣衛、東西兩廠、內行廠四大特務機構并存共生，一時間京城內外緹騎四出，特務橫行，天下騷動，民怨蜂起。直到五年后，也就是明正德五年，即公元1510年，劉瑾倒臺被殺，武宗才下令撤銷西廠和內行廠。西廠和內行廠作為一個孽生的臨時產品，就這樣在中國的歷史上永遠地消失了。
最后說說錦衣衛和東廠、西廠，以及內行廠的區別和關系。大明王朝的這四大特務機構雖然都是朝廷實行間諜政治的工具，但它們相互之間還有明顯區別的。錦衣衛的指揮使一般都是當朝皇帝的心腹武將，其屬下的偵緝諜報人員大都是來自御林軍，或者是專門招募的強兵悍勇，其勢力范圍一般在京城和京畿附近；而東廠、西廠，以及內行廠的特務頭子都是清一色的太監，其屬下偵緝諜報人員也都是太監出身，其勢力范圍遍及全國各地，因此在偏遠地區也能看到“廠”字號特務的身影。
這“廠”字號的三大特務機構在與錦衣衛的關系上，東廠則是后來居上。而西廠、內行廠又居于東廠之上。由于這“廠”字號的三大特務機構的首領都是宮中太監出身，與皇帝的關系密切，又身處皇宮大內，更容易得到皇帝的信任。他們和錦衣衛的關系，逐漸由先前的平級關系變成了后來的上下級關系，在太監權傾朝野的年代，錦衣衛指揮使見了東廠的特務頭子甚至要下跪叩頭。這“廠”字號的三大特務機構的建立，成為了大明王朝太監擅權禍國所依靠的強大力量。由于太監的權勢越來越大，致使參加太監隊伍的人越來越多。據有關史料記載，明朝晚期，全國就有十萬太監之眾，難怪史稱明朝是太監的國度！
其實，朱元璋精心構建明朝的間諜政治制度的初衷，也是為了加強皇權統治，以限制朝臣權力過大。但是不幸的是，朱元璋的子孫們雖盡皆聰明，但卻一個個懈怠朝政，寵信太監，使得間諜政治本身的缺陷被加倍放大。自明成祖以后，太監權力日益強大，皇帝與朝臣都在行政體系中基本都被邊緣化了，明朝的命脈逐漸為太監集團所把握。這也就是大明王朝之所以成為太監國度的根本原因。
